Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms