Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms