Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD38P28907 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD38P28907 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms