Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ITGA3P26006 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA3P26006 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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