Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPREP23469 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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