Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms