Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM21P19474 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms