Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms