Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms