Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms