Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9P02748 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9P02748 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms