Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms