Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SCN2BO60939 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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