Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EDIL3O43854 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms