Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DGG1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DGG1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms