Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGB1P1B2RPK0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms