Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HACD1B0YJ81 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms