Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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