Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms