Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms