Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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UBQLN2Q9UHD9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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