Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms