Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTSFQ9UBX1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms