Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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