Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms