Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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