Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms