Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms