Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC4A5Q9BY07 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms