Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPO3Q9BXY4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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