Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRRTQ9BXP5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms