Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms