Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLVAPQ9BX97 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLVAPQ9BX97 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms