Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAGR1Q9BTK6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms