Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms