Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C2orf88Q9BSF0 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms