Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms