Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP9Q99956 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms