Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms