Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms