Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP3Q96P47 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms