Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms