Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms