Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms