Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms