Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ULK4Q96C45 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ULK4Q96C45 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ULK4Q96C45 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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ULK4Q96C45 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ULK4Q96C45 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ULK4Q96C45 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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