Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms