Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms