Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTC9Q92623 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC9Q92623 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms