Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms